Curso de Espectroscopía en herbario con MicroNIR

Teoría y práctica

Presentación

¡Sean bienvenidos(as)!😊

Este curso fue desarrollado para capacitar a estudiantes y profesionales en el uso del espectrómetro portátil MicroNIR, abarcando desde la configuración inicial del equipo hasta el análisis de los datos espectrales.

A lo largo de tres días de actividades teóricas y prácticas, los participantes explorarán los fundamentos de la espectroscopía en el infrarrojo cercano (NIR) y su aplicación en la identificación de plantas.

Además, el curso busca identificar desafíos prácticos en el uso del equipo, contribuyendo al desarrollo de un protocolo estandarizado de aplicación en el marco del Proyecto SpectraPop.

Detalles del curso

Dónde: Aula del PPG-Botánica y Herbario INPA, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA, campus I), Av. André Araújo, 2.936 - 69067-375 - Petrópolis, Manaus, Amazonas, Brasil.

Fecha: Del 17 al 19 de diciembre de 2025.

Público objetivo: Estudiantes y profesionales involucrados en el flujo de trabajo de herbarios/colecciones de referencia que tengan interés en el uso de la espectroscopía portátil para la investigación científica.

Número de cupos: 20 (cupos presenciales).

Carga horaria: 18 h (con emisión de certificado de participación).

Formato: Híbrido, con clases teóricas impartidas en un entorno virtual, con opción de participación presencial en el aula del INPA, y clases prácticas exclusivamente presenciales. Para las actividades prácticas habrá cuatro laptops disponibles y los participantes se organizarán en cuatro grupos.

Material: Las diapositivas, los scripts y los datos obtenidos durante el curso se pondrán a disposición directamente de los alumnos o a través de GitHub.

Observaciones importantes:

Los participantes externos deben presentar un documento de identidad con foto (p. ej., cédula de identidad o documento nacional) e informar en cualquier portería del INPA que están participando en una capacitación en el Herbario INPA.
Al finalizar el curso, cada participante debe responder un formulario de aprovechamiento para evaluar la capacitación y aportar sugerencias para mejorar el protocolo de uso del MicroNIR, que en el futuro se pondrá a disposición de toda la comunidad interesada.

Cronograma

Visión general

Las actividades del curso se realizarán durante tres días consecutivos, de miércoles a viernes.

Las sesiones de la mañana serán de 09:00 a 12:00 (hora estándar de Amazonas).

Las sesiones de la tarde serán de 14:00 a 17:00 (hora estándar de Amazonas).

Línea de tiempo

Día 1 (miércoles, 17/dic)

Mañana (Flávia)

Fundamentos teóricos de la espectroscopía NIR y sus aplicaciones

Enlace para acceder a la clase: https://meet.jit.si/CursoSpectraPop

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/a2zAf1EhNPwFJcek6

Video: Tour del Espectro Electromagnético (NASA): https://www.youtube.com/watch?v=2p7FPFvu_j0

Tarde (Caroline)

Presentación del dispositivo NIR-S-G1 (MicroNIR, InnoSpectra Corp.) y accesorios
Configuración de la aplicación ISC-NIRScan GUI (laptop y smartphone)
Calibración, recolección de datos espectrales y cuidados necesarios en la obtención de los espectros
Comprensión de los archivos de salida

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/UUx6esK5UtvfUoNs5

Día 2 (jueves, 18/dic)

Mañana (Luiz y Caroline)

Operaciones con el MicroNIR y ejercicio práctico de adquisición de espectros.

Obtención de los metadatos asociados a los ejemplares de herbario.

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/fWo12i6eGNRvphZ38

Tarde (Caroline)

Instalación de las bibliotecas necesarias
Cómo importar las lecturas espectrales a R
Cómo visualizar espectros y evaluar la calidad de los datos espectrales
Cómo preparar los conjuntos de datos para el análisis

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/6rTMCeVAexLfMfeN8

Día 3 (viernes, 19/dic)

Mañana (Flávia)

Fundamentos teóricos de la espectroscopía NIR y sus aplicaciones

Enlace para acceder a la clase: https://meet.jit.si/CursoSpectraPop

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/TzM6XT7Y8AfPhQ8F7

Tarde (Caroline)

Análisis discriminante (LDA) con validación cruzada Leave-One-Out (LOO)
Evaluación básica de los modelos (exactitud y matriz de confusión)
Responder el formulario de aprovechamiento del curso

Enlace para acceder a la lista de asistencia: https://forms.gle/metm2uActUHtmSZr7

Enlace para acceder al formulario de retroalimentación: https://forms.gle/GPvYc9k3WZgeBdXX8

Equipo de organización y capacitación

Profa. Dra. Flávia Durgante (Coordinadora del Proyecto SpectraPop), KIT/INPA/MAUA/ATTO

Dra. Caroline Vasconcelos (Becaria del Proyecto SpectraPop), INPA

Prof. Dr. Michael Hopkins (Colaborador), Curaduría del Herbario INPA

Dra. Samyra Ramos (Colaboradora), INPA

Mg. Kaio Cunha (Colaborador), INPA

Mg. Luiz Melo (Colaborador), INPA

Financiamiento

Este curso forma parte del Proyecto “Popularización del uso de la Firma Espectral de la Especie en la identificación de los árboles del Manejo Forestal Sostenible en la Amazonía - SPECTRA POP”, financiado por la Fundación de Apoyo a la Investigación del Estado de Amazonas (FAPEAM), Convocatoria n.º 006/2024 - Mulher Faz Ciência (Proceso n.º 01.02.016301.04984/2024-17), y cuenta con el apoyo del Herbario INPA a través de la Convocatoria pública MCTI/FINEP/FNDCT n.º 02/2016 – Centros Nacionales Multiusuarios.

Participantes

Certificados

Para generar su certificado, complete el formulario: https://forms.gle/XGg3XCmdMGUPxqCq9