Publicaciones

Artículos científicos

Durgante FM, CC Vasconcelos, HL Hadlich, CL Mallmann, RO Perdiz, KCM Cunha, SR Chaves, C Paquini, K Torralvo, M Hopkins, J Schöngart, MTF Piedade, PA Sá, MLG Conde, & F Wittmann. Near-infrared spectral signature enables tree species identification from herbarium specimens and standing trees in the Amazon Forest using low-cost and reference spectrometers. Sometido a publicación, 2026. Preprint disponible. DOI 10.32942/X2T97T

White DM, FM Durgante, MW Austin, JA Guzmán Q, JA Kennedy, CO Nichodemus, NI Ahlstrand, C Baraloto, B Bekta¸ K Boughalmi, W Cardinal-McTeague, TLP Couvreur, RP Fortier, RS Fuller, OM Grace, R Jackson, K Karbstein, S Kothari, AK Lee, JL Viana, E Martinez-Victoria, JE Meireles, TH Murphy, C Rodrigues-Vaz, D Spalink, H Tuomisto, CC Vasconcelos, & J Cavender-Bares. A Protocol for Standardizing Measurements and Enabling Global Harmonization of Herbarium Leaf Reflectance Spectra. Sometido a publicación, 2026. Preprint disponible. DOI 10.32942/X2SD4D

Hadlich HL, J Schöngart, F Wittmann, CC Vasconcelos, CL Mallmann, MLG Conde, PA Sá, LO Demarchi, GB Mori, MTF Piedade, & FM Durgante. 2025. Exploring the potential of field spectroscopy for tree species identification in different Amazonian forest ecosystems. Global Ecology and Conservation, 54: e03970. DOI 10.1016/j.gecco.2025.e03970

Cavender-Bares J, DM White, NI Ahlstrand, M Austin, D Bastianelli, S Bazan, K Boughalmi, W Cardinal-McTeague, E Chacón-Madrigal, TLP Couvreur, C Davis, FM Durgante, OM Grace, JA Guzmán, K Hansen, MS Hernández-Leal, MJG Hopkins, R Jackson, S Kothari, AK Lee, E Léveillé-Bourret, J Pinto-Ledezma, NLQ Casaverde, JE Meireles, B Neto-Bradley, CO Nichodemus, RH Ree, M Schmull, DE Soltis, PS Soltis, H Tuomisto, S Ustin, & CC Vasconcelos. 2025. Next-generation specimen digitization: capturing reflectance spectra from the world’s herbaria for modeling plant biology across time, space, and taxa. New Phytologist (versión de registro). DOI 10.1111/nph.70645

Robin M, FM Durgante, CL Mallmann, HL Hadlich, C Römermann, LS Falcão, CD Lacerda, s Duvoisin, F Wittmann, MTF Piedade, J Schöngart, & EG Alves. 2025. Leaf spectroscopy as a tool for predicting the presence of isoprene emissions and terpene storage in central Amazon forest trees. Plant Methods 21(1): 78. DOI 10.1186/s13007-025-01400-w

Vasconcelos CC, IDK Ferraz, FM Durgante, F Wittmann, J Schöngart, MTF Piedade, JLC Camargo, & MH Terra-Araujo. 2025. Ecclinusa nervosa (Sapotaceae, Chrysophylloideae), a new species discovered in Central Amazonia. Systematic Botany 50(1): 55-66. DOI 10.1600/036364425X17466502618821

Libros e informes

Antonelli A, C Fry, RJ Smith, J Eden, PJ Kersey, I Larridon, AJ Paton MSJ Simmonds, AM Ainsworth, SP Bachman, M Cheek, CC Davis, F Forest, S Lennon, DP Little, M Nesbitt, E Nic Lughadha, SA Smith, T Wilkinson, …FM Durgante,… CC Vasconcelos, et al. 2026. State of the World’s Plants and Fungi 2026. Royal Botanic Gardens, Kew. DOI 10.34885/rdzs-ky83

Material instruccional

White DM, NI Ahlstrand, MW Austin, D Bastianelli, S Bazan, K Boughalmi, W Cardinal-McTeague, TLP Couvreur, F Durgante, OM Grace, JA Guzmán Q, K Hansen, M Hopkins, R Jackson, JA Kennedy, S Kothari, AK Lee, É Léveillé-Bourret, JE Meireles, BM Neto-Bradley, CO Nichodemus, NL Quinteros Casaverde, C Rodrigues-Vaz, M Schmull, PS Soltis, D Spalink, CC Vasconcelos, JL Viana, H Tuomisto, T Wells, & J Cavender-Bares. 2025. IHerbSpec Protocol. Zenodo. DOI 10.5281/zenodo.15849668

Vasconcelos CC & FM Durgante. 2025. R codes and datasets used in the course ‘Herbarium Spectroscopy with MicroNIR: theory and practice’. Zenodo. DOI 10.5281/zenodo.15531968

Participación en eventos

Resúmenes

Cunha KCM, FM Durgante, CC Vasconcelos, F Farroñay, JB Silva, A Andrade, & A Vicentini. Resumen: Near-infrared spectroscopy (NIRS) reveals a new species and validates the delimitation of genus Manilkara Adans. in Central Amazonia. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Ferreira ER, FM Durgante, CC Vasconcelos, MCAMO Ramos-Ferro, SR Chaves, KCM Cunha, & MJG Hopkins. Resumen: Building a spectral library for the identification of the genus Dipteryx Schreb. (Fabaceae) at the INPA Herbarium. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Silva TAM, CC Vasconcelos, MTF Piedade, C Dapolito-Junior, MCAMO Ramos-Ferro, FM Durgante, & LO Demarchi. Resumen: Can near-infrared spectroscopy distinguish morphotypes of Mabea speciosa (Euphorbiaceae s.s.)?. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Guedes YJG, FM Durgante, CC Vasconcelos, MCAMO Ramos-Ferro, KCM Cunha, SR Chaves, MJG Hopkins. Resumen: Building a spectral library for the identification of the Bignoniaceae family at the INPA Herbarium. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Ataide CS, FM Durgante, CC Vasconcelos, MCAMO Ramos-Ferro, SR Chaves, KCM Cunha, MJG Hopkins. Resumen: Portable NIR Spectroscopy for species discrimination in Ecclinusa (Sapotaceae): Can Amazonian species be distinguished using a low-cost instrument?. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Durgante FM, CC Vasconcelos, MCAMO Ramos-Ferro, SR Ramos-Chave, HL Hadlich, CL Mallmann, KCM Cunha, MJG Hopkins, A Vicentini. Resumen: HerbSpectra-Amazonia: A spectral herbaria network for automated Amazonian species identification. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Ramos-Ferro MCAMO, CC Vasconcelos, SR Chaves, KCM Cunha, TAM Siva, MJG Hopkins, & FM Durgante. Resumen: Standardizing NIR spectroscopy measurements of herbarium specimens: A comparison of background materials using three Sapotaceae species. En: Taller Franco-Brasileño “Botánica del Futuro: Nuevos Enfoques para el Estudio de la Flora Amazónica”, Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Junio/2026.

Durgante FM, CC Vasconcelos, MCAMO Ramos-Ferro, SR Chaves, HL Hadlich, CL Mallmann, KCM Cunha, YJG Guedes, EL Cunha, CS Ataide, ER Ferreira, TAM Silva, MJG Hopkins, A Vicentini, LO Demarchi, D Gris, KC Torralvo, RM Rabelo, F Wittmann, MTF Piedade, & J. Schongart. Resumen: Popularización del uso de la Firma Espectral de la Especie en la identificación de los árboles del Manejo Forestal Sostenible en la Amazonía: Proyecto SpectraPop.. En: 4.º ERBOT NORTE - Encuentro Regional de Botánicos del Norte, Universidad Federal de Pará (UFPA), Belém, PA, Brasil. Abril/2026.

Lima KT, KAL Santos, JB Moreira, CC Vasconcelos, FM Durgante, & HS Pereira. Resumen: Espectroscopía NIR aplicada a la identificación de etnovariedades de Ananas comosus. En: XXI Semana de Agronomía (SEMAGRO), Universidad Federal de Amazonas (UFAM), Manaus, AM, Brasil. Octubre/2025. RESUMEN https://shre.ink/L29n

Conferencias

Durgante FM. Conferencia: HerbSpectra Amazônia and Spectrapop projects in the Amazon Forest. En: IHerbSpec Research Symposium and Meeting, Missouri Botanical Garden, St. Louis, EE. UU. Mayo/2026.

Durgante FM, JL Viana, CC Vasconcelos, HL Hadlich, & CL Mallmann. Simposio: Espectroscopía aplicada a la identificación de plantas: avances para herbarios, manejo y conservación. En: 75.º Congreso Nacional de Botánica y 39.ª Reunión Nordestina de Botánica, Universidad Federal del Delta del Parnaíba (UFDPar), Parnaíba, PI, Brasil. Agosto/2025.

Torralvo KC, R Holanda, IY Fernandes, AP Lima, C Pasquini, FM Durgante, & WE Magnusson. Conferencia: Uso de la espectroscopía NIR en el reconocimiento de anuros: método, pruebas de eficiencia y perspectivas de aplicación, incluidos equipos de bajo costo. En: XI Congreso Brasileño de Herpetología, Sociedad Brasileña de Herpetología, Manaus, AM, Brasil. Agosto/2025.

Durgante FM. Conferencia: Spectral herbarium from INPA: equipment, methods and applications to species identification. En: International Herbarium Spectral Digitization (IHerbSpec) Working Group, Harvard University Herbaria, Cambridge, MA, EE. UU. Mayo/2025. YouTube https://www.youtube.com/live/Zko1-NvlGUE

Minicursos

Durgante FM, CC Vasconcelos, & KCM Cunha. Minicurso: Firma espectral de las especies: teoría y práctica de la espectroscopía en herbario con NIR portátil. En: 4.º ERBOT NORTE - Encuentro Regional de Botánicos del Norte, Universidad Federal de Pará (UFPA), Belém, PA, Brasil. Abril/2026. Personas capacitadas: 4.

Torralvo KC. Minicurso: Teoría y diseño de muestreos espectrales de infrarrojo cercano (NIR) para el reconocimiento de la biodiversidad. En: 21.º Simposio sobre Conservación y Manejo Participativo en la Amazonía, Instituto de Desarrollo Sostenible Mamirauá, Tefé, AM, Brasil. Julio/2025. Personas capacitadas: 30.

Exposición

YJG Guedes, EL Cunha, ER Ferreira. En: 22.ª Semana Nacional de Ciencia y Tecnología del INPA. Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía (INPA), Manaus, AM, Brasil. Octubre/2025.

Asesorías

En curso

Maria Clara Abreu Mota de Oliveira Ramos Ferro (MAUA/INPA). Estudiante de maestría, PPGBOT-INPA: ¿Importa el material de fondo? Probando patrones de reflectancia en la espectroscopía de hojas de herbario sobre diferentes tipos de material de fondo y su eficacia en la discriminación de especies. Inicio: Marzo/2025. Asesoría: Flávia Durgante. Coasesoría: Caroline Vasconcelos.

Túlio Alex Martins da Silva (MAUA/INPA). Estudiante de doctorado, PPGBOT-INPA: Desentrañando el género Mabea Aubl. (Euphorbioideae: Euphorbiaceae) en la Panamazonía. Inicio: Enero/2026. Asesoría: Layon Demarchi. Coasesoría: Caroline Vasconcelos.

Concluidas

Caroline L. Mallmann (UFSM/MAUA/INPA). Doctorado PPGGEO-UFSM: Applications of Remote Sensing in a drought gradient in Amazon Forest Ecosystems. Inicio: Marzo/2021. Fin: Junio/2026. Asesoría: Waterloo Pereira Filho. Coasesoría: Flávia Durgante.

Hilana L. Hadlich (MAUA/INPA). Doctorado PPGBOT-INPA: Reconocimiento de especies y características funcionales de los árboles en campo mediante espectroscopía en el visible e infrarrojo cercano en la Amazonía. Inicio: Marzo/2021. Fin: Junio/2026. Asesoría: Flávia Durgante. Coasesoría: Jochen Schöngart.

Yasmin Jéssica Guimarães Guedes (UFAM/ Herbario INPA). Estudiante de pregrado, PIBIC-INPA: Construcción de una biblioteca espectral aplicada a la identificación de Bignoniaceae en el Herbario INPA. Inicio: Septiembre/2025. Fin: Agosto/2026. Asesoría: Michael Hopkins.

Cassia Sousa Ataide (UFAM/Herbario INPA). Estudiante de pregrado, PIBIC-INPA: Inteligencia artificial aplicada a la taxonomía de Ecclinusa (Sapotaceae): validación espectral e interoperabilidad con espectrómetros portátiles. Inicio: Febrero/2026. Fin: Agosto/2026. Supervisión: Michael Hopkins.

Egresados

Eliandra Rodrigues Ferreira (Estácio/Herbario INPA). Estudiante de pregrado, PIBIC-INPA: Desarrollo de bibliotecas espectrales para la identificación de especies en el Herbario INPA: un estudio con Fabaceae y Meliaceae. Inicio: Septiembre/2025. Fin: Agosto/2026. Asesoría: Michael Hopkins.

Eduardo Leandro Cunha (UFAM/ Herbario INPA). Estudiante de pregrado, PIBIC-INPA: Inteligencia artificial aplicada a la taxonomía de Ecclinusa (Sapotaceae): validación espectral e interoperabilidad con espectrómetros portátiles. Inicio: Septiembre/2025. Fin: Enero/2026. Supervisión: Michael Hopkins.

Cursos oficiales

Durgante FM, & CC Vasconcelos. Curso de Espectroscopía en herbario con MicroNIR: Teoría y práctica, realizado del 2 al 4 de abril de 2025 (18 horas). Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía, Manaus, AM, Brasil. Personas capacitadas: 13.

Durgante FM, CC Vasconcelos, & LS Melo. Curso de Espectroscopía en herbario con MicroNIR: Teoría y práctica, realizado del 17 al 19 de diciembre de 2025 (18 horas). Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía, Manaus, AM, Brasil. Personas capacitadas: 12.

Durgante FM, SR Chaves, CC Vasconcelos, KCM Cunha, RP Souza, DL Komura, FAG Silva, F Farroñay, LO Demarchi, MJG Hopkins, SM Bulthuis, VN Yoshikawa, YR Santos, AS Lima, & RAF Gurgel. Curso para Auxiliares de Campo ATTO 2026: Grupo Paulo Boca, realizado del 23 al 30 de marzo de 2026 (66 horas). Sitio ATTO, São Sebastião do Uatumã, AM, Brasil. Personas capacitadas: 13.

Durgante FM, CC Vasconcelos, KCM Cunha. Firma espectral foliar en herbario, realizado del 4 al 6 de mayo de 2026 (18 horas). Museu Paraense Emílio Goeldi, Belém, PA, Brasil. Personas capacitadas: 15.

Durgante FM, SR Chaves, KCM Cunha. Curso de Espectroscopía en herbario con NIR portátil: Teoría y práctica, realizado del 9 al 11 de junio de 2026 (18 horas). Instituto de Desarrollo Sostenible Mamirauá, Tefé, AM, Brasil. Personas capacitadas: 8.

Asignaturas

Durgante FM. Asignatura: Tópico Especial - Uso de la espectroscopía para el reconocimiento de la biodiversidad, realizada del 25 de agosto al 6 de septiembre de 2025 (60 horas). Instituto Nacional de Investigaciones de la Amazonía, programa de maestría y doctorado del Programa de Posgrado en Botánica (PPGBOT). Personas capacitadas: 10.

Aplicaciones web

Vasconcelos CC, M Hopkins, & FM Durgante. 2026. Biblioteca Espectral del Proyecto SpectraPop – Dashboard desarrollado para facilitar la visualización de la biblioteca espectral del Proyecto SpectraPop en el Herbario INPA. APP https://spectrapop.shinyapps.io/dashboard/

Vasconcelos CC, KCM Cunha, & FM Durgante. 2025. iscreader app – Aplicación web desarrollada para facilitar la importación, visualización y procesamiento de los archivos sin procesar generados por el espectrómetro portátil MicroNIR modelo NIR-S-G1 (InnoSpectra Corp). APP https://spectrapop.shinyapps.io/iscreaderapp/

Vasconcelos CC & FM Durgante. 2025. multispecreader app – Aplicación web desarrollada para facilitar la importación, visualización y procesamiento de los archivos sin procesar generados por los espectrómetros Antaris™ II (FT-NIR Analyzer, Thermo Fisher Scientific Inc.) y ASD FieldSpec® (Malvern Panalytical Ltd). APP https://spectrapop.shinyapps.io/multispecreaderapp/